Molte applicazioni, come quelle di Microsoft® Office 2010, dispongono di strumenti inchiostro propri che è possibile usare per scrivere nei contenuti dell'applicazione.
Quando si apre un'applicazione dotata dei propri strumenti inchiostro, SMART Ink viene attivato per impostazione predefinita ed è possibile scrivere sopra l'applicazione.
Se si desidera scrivere nei contenuti dell'applicazione, è possibile disattivare SMART Ink e usare gli strumenti inchiostro dell'applicazione. Gli oggetti e le note della finestra scompaiono quando si disattiva SMART Ink e sono ripristinati quando si attiva SMART Ink.